Formé à Lille, Niakhaté (28 ans, 1,90 m), défenseur central gaucher, a débuté sa carrière à Valenciennes à l'âge de 18 ans au cours de la saison 2014-2015 en Ligue 2 avant d'être transféré à Metz en 2017 pour jouer en Ligue 1, puis en Bundesliga à Mayence de 2018 à 2022 où il avait été transféré pour dix millions d'euros.

Il évoluait à Nottingham Forest depuis 2022, disputant un total de 37 matches avec l'équipe anglaise avec laquelle il avait encore deux ans de contrat.

International sénégalais depuis 2023, il compte onze sélections avec les Lions de la Teranga après avoir été en équipe de France chez les jeunes, jusqu'en Espoirs.